Cécile HEYVAERT

En résumé

Entreprises

• DEXSTR - Ingénieur Développeur

  2015 - maintenant

• C-S SI - Ingénieur en développement Java JEE

  2015 - 2015 Conception d'un portail Web JEE pour les prospects
  Recueil des besoins après de l'équipe commerciale, maquettage
  Rédaction des spécifications fonctionnelles
  Développement du site web en JEE : utilisation d'Apache tomcat + mysql (installation de tomcat, création et gestion de la base de donnée sous debian 7), développement en Java JEE avec hibernate et struts, ajout du CSS

• C-S - Ingénieur en développement Python

  2014 - 2015 Fusion de chaîne de traitement satellite
  
  Rétro-documentation des modules IDL
  Préparation des cas de test pour valider les performances et la qualité de la nouvelle chaîne
  Développement de modules de traitement d'image (format HDF) en Python 2.7 (Programmation Orientée Objet) inclus dans des scripts ksh
  Préparation et passage des tests unitaires avec unittest

• C-S SI - Ingénieur Valideur

  2012 - 2014 Dans le cadre du prototype d’un outil de validation d’une base documentaire de données techniques aéronautique au format ASD S1000D :
  Participation à la spécification d'un modèle générique de validation d'une base documentaire A350
  Implémentation d’une base documentaire S1000D d’évaluation :
  Implémentation d’une base documentaire de production A380 à la norme ATA
  Participation à la réflexion sur un outil d’aide au diagnostic pour la validation de données A350
  Validation de données en XML ou SGML des données techniques avions ou équipementiers.
  Conception d'application en java pour la validation de données A350 (libraires Sax et Dom pour les arbres XML et de junit)
  Rédaction des tests unitaires A350
  Validation des données A350 issue d’airbus, équipementiers ou motoristes
  Maintenance des scripts balise pour l’A380
  Maintenance des plans de test pour la validation des données SGML
  Validation des données SGML Airbus, équipementiers ou motoristes
  Participation aux outils de développement de visualisation des résultats de validation A350 (utilisation de Java)

• INRA - Stagiaire (développement Python)

  Paris 2011 - 2011 Je suis arrivée à l'INRA de Castanet-Tolosan dans le département MIA (Mathématique et Informatique Appliquée) début mars 2011 et j'en suis repartie fin août 2011.
  
  Durant ces six mois j'ai travaillé à la conception d'une chaîne de traitement des miRNAs. Les miRNAs sont de petits ARNs qui peuvent interrompre l'expression d'un gène en bloquant un ARN messager. Ils interviendraient dans le cadre d'une réponse de la cellule à un virus, des mécanismes d'apoptoses ou de certains cancers.
  
  Je disposais d'un très important volume de données _plusieurs centaines de giga-octets, issues du séquençage d'une espèce animale. Sous la direction de Christine Gaspin, Jérôme Mariette et Philipe Bardou, mes encadrants, j'ai réalisé en python 2.6 les scripts nécessaires au nettoyage des données, l'alignement des séquences de bonne taille sur le génome de l'espèce concernée puis l'affichage des résultats avec la probabilité que la séquence sélectionnée soit bien un miRNA.

• Ecole Polytechnique - Stagiaire

  91128 PALAISEAU Cedex 2010 - 2010 Ce stage a eu lieu au Laboratoire d'Informatique de l'Ecole Polytechnique (LIX) au sein de l'équipe de recherche en BioInformatique. Sous la direction de Mr Balaji Raman et de Mireille Regnier , j'ai travaillé sur la détection des TPP riboswitch. Les TPP riboswitch sont des molécules d'ARN non codantes repliées dans l'espace sous une certaine forme et remplissant des fonctions encore mal connues.
  Pour cela j'ai utilisé DARN! un logiciel développé au Laboratoire de Recherche en Informatique de l'université Paris-Sud 11 (LRI) qui a été détourné de sa fonction: il sert normalement à afficher la structure la plus probable d'une molécule à partir d'un schéma (pattern) et de sa séquence nucléotidique. Ici il a été utilisé pour examiner la probabilité qu'une molécule ait une chance d'être un TPP riboswitch via son calcul de l'énergie libre.
  
  J'ai ensuite fait des calculs statistiques pour comparer ses performances de détection (courbe ROC, spécificité, sensibilité) par rapport à d'autres logiciels.

• Laboratoire de Génétique et Evolution des Populations Végétales à l'USTL - Stagiaire

  2009 - 2009 Cette expérience a duré 6 semaines sur le campus de Lille 1. Ceci fut mon premier stage _et mon premier contact avec la Bioinformatique, à la fin de ma licence. J'ai travaillé sur un logiciel conçu par mon maître de stage, Mr Sylvain Billiard (maître de conférence à L'USTL). Ce logiciel avait pour but de prédire l'incompatibilité de reproduction entre des plans d'Arabidopsis thalianna en sachant qu'une anomalie avait été repérée sur ces incompatibilités (liées à une inversion de dominance allélique).
  
  Au cours de stage j'ai également pu avoir accès au code du logiciel, Nessi, écrit en C++ et y a apporter des modifications mineures.

Formations

• CQP ARE (CENTRE DE QUALIFICATION PROFESSIONNELLE) - FAFIEC

  Toulouse 2014 - 2014 * UML 2 (1 semaine)
  * Java (2 semaines)
  * JEE (2 semaines)
  * Langages Web (HTML5, CSS3 et Javascript) 1 semaine

• Université Paris 11 Paris Sud

  Orsay 2009 - 2011 Master de Bioinformatique et Biostatiques
  
  Manipulation de bases de données Oracle et mySQL, Biostatistiques, Programmation web (HTML/PHP), Data-mining, Optimisation algorithmique, Analyses statistiques, Analyses d'images, Alignements de séquences, Bio-informatique structurale
  Utilisation de diverses bases de données bioinformatiques : SwissProt, NCBI, Rfam et leur inclusion dans des pages web ou programmes.
  Langage étudiés : Python, Pe

• Université Paris 11 Paris Sud

  Orsay 2009 - 2011 Master de Bioinformatique et Biostatistiques

• Université Lille 1 Sciences Et Technologies

  Villeneuve D'Ascq 2006 - 2009 Licence de Biologie des organismes et population
  
  Lieu : Université Paris-Sud 11

• Université Lille 1 Sciences Et Technologies (Lille)

  Lille 2006 - 2009 Licence Biologie des Organismes et Populations

Réseau

• Alexandre GALOPIN

• Anita KOWAL

• Cécile PEREIRA

• Frédéric MAHÉ

• Grégoire LANSSADE

• Sylvain BONNET

• Valentine BORDES